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在校内还附设了农业部和北京市的一些农科教机构：1999年初，学校经市政府农林办公室批准，成立了全国和北京市先进家农业职业教育研究所——北京农业职业教育研究所，主要从事与农民职业教育有关的农科教结合、绿色证书工程、农业职教师资培训基地的建设等方面的研究和服务工作；1998年经北京市农委批准成立的北京市先进农村实用技术培训中心，旨在直接为农民提供快捷的技术咨询和技术培训等服务，1999年学校因此被农业部科教司正式确定为44所全国农业职业技术教育(师资)培训示范基地之一，同时被北京市妇联确定为“北京市妇联农村妇女科技培训基地”；1999年北京市农业广播电视学校正式并入学校，北京市农业广播电视学校原归属北京市成人教育局，受中央农业广播电视学校业务指导，是一所以电视广播为主要手段的成人中等专业学校，是全国38个省、市级农广校之一。2000年5月，经市政府有关部门批准，归属农口管理，与农业学校合属办公；另外学校还附设有北京市农业职工中专、全国农业中专电化教学服务中心、农业部农业职业教育委员会秘书处等农业教育服务和管理咨询机构。

同时，在农业部科技教育司的支持和帮助下，由学校负责管理的北京农业职业教育研究所与全国农业职业技术教育研究会联合创办了《中华农职教网》，于2001年9月1日正式开通，《中华农职教网》设有政策法规、农职教工作、农民教育、农科教动态、教改动态、农职教英才、名校风采、招生与就业、校办产企业、海外农职教、综合信息、农职教论坛、致富大篷车、成教在线等专栏，大大增加了学校职教等方面的信息量，体现了学校在全国农业职业教育战线上的重要作用。